一、适用孕周不同

药物流产适合末次月经停经天数在49天以内的女性，而手术流产则适合怀孕14周以内的女性。如果停经天数超过了49天，选择药流很可能会因为胎儿相对较大而不完全流产，之后仍需要进行手术对身体造成二次伤害，所以一般停经59天以上适合选择手术流产。

二、流产方式不同

药物流产是通过服用米非司酮和前列腺素来进行流产。先要服用具有抗孕酮作用的米非司酮，阻断内源性的孕激素活性，使胎囊脱离子宫内膜。然后再服用米索前列醇等前列腺素，促进子宫收缩，让宫颈软化、开张，使得胎囊得以排出子宫。